پس از ارسال جوابیه، روزنامه های فوق الذکر از چاپ جوابیه خودداری کردند. این گزارش ها پس از سخنان حسن روحانی در تمجید از عملکرد هسته یی دولت خاتمی به نگارش درآمدند. حسن روحانی در اظهار نظری تصریح کرد سال 81 نقطه بسیار مطلوب در روند برنامه هسته یی ایران محسوب می شود. بیان همین مساله کافی بود که دولت و حامیان آن نسبت به مواضع روحانی جبهه گیری کنند. البته حسن روحانی به عنوان دبیر شورای عالی امنیت ملی دولت خاتمی، همواره مدافع عملکرد دولت اصلاحات بوده است به گونه یی که پس از پخش برنامه مستند هسته یی از صدا و سیما که در آن برنامه، دولت خاتمی را دولتی ترسو و دولت احمدی نژاد را دولتی شجاع نامیده بود، حسن روحانی در مقام پاسخگویی برآمد و نسبت به این عملکرد هشدار داد.

البته دفاع حسن روحانی باز هم ادامه یافت به گونه یی که در اظهارنظر دیگری از عملکرد هسته یی دولت خاتمی تقدیر کرد اما بیان همین مساله کافی بود که اصولگرایان واکنش نشان بدهند. حسن کامران نماینده اصفهان در مورد سخنان روحانی گفت؛ همه گروه ها و جریان های سیاسی معترف هستند که بنیاد فعالیت های صلح آمیز هسته یی کشور از سال های بسیار دور گذاشته شد و هر دولتی هم به نسبت توانایی های خود برای ادامه این فعالیت ها تلاش کرد اما بی انصافی است که جسارت و ایستادگی شجاعانه دولت نهم و دهم را در به ثمر رسیدن این تلاش جمعی نادیده انگاریم. بیان حرف های قشنگ کار قصه گوها است. نکته مهم این است که این حرف ها در صورتی زیبا نقش می شوند که اجرای خوب و قوی داشته باشند.

موسی قربانی عضو فراکسیون اصولگرایان مجلس هشتم با بیان اینکه اسناد پذیرش تعلیق از سوی دولت اصلاحات و تیم مذاکره کننده حسن روحانی در خصوص مسائل هسته یی موجود است، یادآور شد؛ حسن روحانی مسوول مذاکرات هسته یی دولت اصلاحات به مجلس شورای اسلامی آمد تا نمایندگان وقت را برای پذیرش تعلیق توجیه کند. قربانی اظهار داشت؛ عین جمله حسن روحانی در جلسه غیرعلنی مجلس این بود که فرآیند اصل 110 طی شده است. یعنی روحانی تلاش می کرد که به نمایندگان بگوید رهبر معظم انقلاب هم با تعلیق موافق است. وی گفت؛ انکار این حقیقت که پذیرش تعلیق از سوی افرادی رخ داده است که امروز ادعای انجام فعالیت های هسته یی را به نام خود ثبت می کنند، همان قدر غیرممکن است که بیان شود دولت های قبلی نقشی در فعالیت های صلح آمیز هسته یی کشور نداشته اند. ایرنا نیز با انتشار گزارشی تحت عنوان «حسن روحانی به کدام سمت می رود» از وی انتقاد کرد. در این گزارش آمده است؛ «در زمان دولت آقای خاتمی توانستیم- البته با همت دانشمندان جوان کشورمان- خودمان سانتریفوژ تولید کنیم. پس چرا در زمانی که شما مسوولیت مذاکرات هسته یی را برعهده داشتید، نه تنها غنی سازی بلکه تمامی فعالیت های هسته یی کشورمان را به حال تعلیق درآوردید؟ در زمانی که مسوول پرونده هسته یی ایران بودید کار به جایی رسید که غربی ها با وقاحت تمام می گفتند باید تحقیقات دانشگاهی خود را نیز تعلیق کنید. آیا منکر این مساله هستید؟ آقای روحانی ممکن است بفرمایید واژه تعلیق داوطلبانه غیرالزام آور در کدام یک از کتب حقوق بین الملل وجود دارد و آیا این واژه توسط تیم مذاکره کننده یی که شما هدایت آن را برعهده داشتید، تولید نشد؟ می توانید بگویید در چند توافقنامه و قرارداد بین المللی از این واژه استفاده شده است؟

 آقای روحانی، در بخش دیگری از گفت وگوی خود با خبرگزاری مهر گفته اید غربی ها قصد دارند در موضوع مبادله سوخت نیروگاه تهران تعلیق سه یا چهارساله غیرآشکاری را بر ما تحمیل کنند. می توانید بگویید آیا جمهوری اسلامی و تیم مذاکره کننده هسته یی مبادله اورانیوم 5/3 درصد با سوخت 20 درصد را مطابق با نظر کشورهای طرف مذاکره پذیرفته است یا نه؟ آیا جمهوری اسلامی سه گزینه خرید، مبادله و در نهایت تولید را برای تامین سوخت نیروگاه تهران مطرح نکرده است که خود نشانگر انعطاف دیپلماسی هسته یی در دولت کنونی است؟ آیا تیم مذاکره کننده هسته یی ضمن پذیرش اصل مبادله اعلام نکرده است تنها در صورت دریافت تضمین های عینی و پذیرش شرط های ایران از جمله مبادله در خاک ایران حاضر به انجام مبادله است؟»

 البته پس از این جنجال سازی ها و انتشار گزارش هایی در دو روزنامه اصولگرا، حسن روحانی بار دیگر در مقام پاسخ برآمد و تصریح کرد؛ آنچه بعد از مذاکرات طولانی هیات مذاکره کننده با تروئیکا اروپایی و آژانس انرژی اتمی صورت گرفت، منتج به آن شد که هم اصفهان، هم اراک و هم بقیه مراکز تهیه و تولید هسته یی فعالیت خود را ادامه دهند، و فقط گازدهی نطنز به مدت کوتاهی آن هم نه به صورت الزامی بلکه به صورت داوطلبانه به تعلیق درآید. این به معنی آن بود که فقط 10 درصد فعالیت به مدت کوتاهی تعلیق شود. اما آنچه طی این چند سال اخیر اتفاق افتاده آن است که چند قطعنامه تحریم علیه ایران صادر شده و الان هم بعضی ها قصد دارند ماحصل این زحمات را به خارج از ایران منتقل کنند. در آن زمان در سایه تعلیق محدود و موقت فناوری های U.C.F، ساخت سانتریفوژها و فعالیت اراک و بندرعباس تکمیل شد و ادامه یافت. در ضمن همه تصمیمات اتخاذشده در زمان ایشان تصمیمات نظام بوده و با تایید و نظارت دقیق و جزء به جزء مقامات عالیه نظام صورت گرفته و تصمیم فردی نبوده است